瑪利歐收到碧姬公主寄來一封寫著「請幫助我尋找寶物」的信而來到了「惡棍鎮」。但在當地卻找不到碧姬公主的蹤影，為了獲得碧姬公主下落的線索，瑪利歐探訪鎮上長期研究寶物的富朗克栗教授，從他口中得知「千年之門」能通往寶物所在處，但必須先收集7個「星之石」才能將門開啟，「調查寶物就能見到碧姬公主！」如此判斷的瑪利歐與在鎮上認識的克栗斯汀一起在紙片世界中展開了尋找星之石的冒險，當撞上敵人時就會展開戰鬥。戰鬥的舞台竟然是個劇場！發動攻擊時抓準時機按下按鍵，成功的話不但能提升給予敵人的傷害，還可以帶動觀眾的情緒炒熱戰鬥的氣氛。